Die Ursprünge der Kirche gehen auf das früher auf dem Kahlenberg gelegene Kamaldulenserkloster zurück. Die Kamaldulenser begannen dort 1628/29 mit dem Bau der Eremitage. Die Kirche wurde wurde 1629 bis 1639 errichtet. Während der Zweiten Wiener Türkenbelagerung wurde die Kirche 1683 von den Türken zerstört. Die Ordensbrüder kamen bereits im selben Jahr wieder zurück, der Wiederaufbau der Kirche verzögerte sich und war erst 1734 vollendet.